El doctorado tiene como finalidad formar académicos que produzcan aportes relevantes para el progreso del país, en un proceso de desarrollo sostenible. En este sentido, su objetivo fundamental es la formación de académicos, investigadores y profesionales de excelencia en cuatro disciplinas entre de las ciencias sociales, entre ellas Antropología, Arqueología, Historia y Sociología, para que adquieran la solvencia del caso para efectuar contribuciones relevantes a nivel nacional, regional, subnacional e internacional.

Este programa tiene como espíritu crear un espacio en el que converjan los docentes y estudiantes del doctorado con académicos del ámbito nacional, para la investigación y discusión sobre cuestiones fundamentales del proceso de desarrollo de la sociedad peruana, así como del desenvolvimiento de los asuntos sociales, políticos y culturales en el país. Por eso, se motivará para que los egresados participen en la generación de ideas, conceptos y propuestas sobre los problemas nacionales.

El programa de doctorado también se compromete de modo específico a analizar y explicar las realidades históricas, sociales y políticas de América Latina.